先端科学・健康医療融合研究機構には以下の組織および関連研究機構があります。

ナノ加工のファウンダリー、計測評価、バイオスキルなど、先端研究推進のためのスキルを獲得する場としてＳＯＬを2005年4月に設置しました。ここではＢＭＥインスティテュートなどの若手研究者が結成した分野融合型研究チームの活動の場であると共に、学内外の研究者のＯＪＴ、ＯＲＴの場としての機能を果たします。

また、本機構がキャリアパスの頂点として創生する新しい職種であり、専門的学識、経験に加えて、ＭＯＴ・知財の素養を持ち、産学連携を具体的に進めることのできるスーパー・テクノロジー・オフィサー（ＳＴＯ）を育成するためのカリキュラムを実施するための場としても機能します。