先端科学・健康医療融合研究機構には以下の組織および関連研究機構があります。
ナノ理工学研究機構 ナノ理工学インスティテュートは、学内におけるナノテクノロジー関連の諸活動を統合し、機能のより一層の強化・充実、および学外からのワンストップのアクセスを図ることを目的に設立されました。
ナノ理工学に関する先端的研究機関として機能するだけでなく、卓越した研究者および技術者を輩出するための教育機能をもち、さらに起業支援や研究戦略立案のできる複合的組織を目指しています。