先端科学・健康医療融合研究機構には以下の組織および関連研究機構があります。

生命医療工学インスティテュートと連動して先端科学と健康医療の融合した研究と教育を効果的に推進するため、学内の教育機関として先端科学・健康医療融合大学院（仮称）の設置を目指しています。

国際的に活躍できる大学院学生を育成し、将来、ポストドクターが高度な研究を展開できるのみならず、科学技術研究のシステム改革の先鋒を担えるスーパー・テクノロジー・オフィサー（STO）へ飛躍できるキャリアパスとしても位置づけられます。 現在、将来計画検討会において、検討を進めています。